忙活了一早上,走出实验室已经是早晨七点多,刚好是早饭时间。
叶蓁蓁刚到g省疾控,很多地方不熟悉,王亚楠很热心地带着叶蓁蓁去了中心食堂,一起吃过早饭,王亚楠叹道:“我们平时最怕遇到紧急疫情,每次遇到都要加班,这次还好,样品是早晨五点送到的,以前经常是凌晨一两点,忙活完,一整晚都不用睡觉了,你们国家cdc也经常这样吧?”
叶蓁蓁想起之前儿童福利中心爆发的出血热疫情,当时就是整晚没睡地做实验,现在再听王亚楠的诉苦,感同身受地笑了笑,“嗯,一样啊。”
想起这次来g省的任务,叶蓁蓁主动要求说:“从百子村死者标本分离出来的炭疽杆菌,你们做了序列分析吧?”
“嗯,昨天刚做了初步序列分析,叶老师,你想看结果?”
“是的,昨晚在报告会上,主讲人说过,这次分离出来的炭疽菌株跟b市之前流行的菌株,同源性很低,那跟这次菌株同源性最高的菌株是在哪个流行区分离出来的?”
王亚楠摇摇头,“昨天跟国内几个流行株做了初步比对分析,没有跟这次分离到的菌株同源性超过百分之九十的。”
“什么?同源性这么低!按照现在的数据,它都可以单列一个菌种了。”
“是啊,这就是这次疫情奇怪的地方,要不,我们g省疾控也不会向国家cdc求助了,刚才就算叶老师不提这件事,我也要带你去看昨天做出来的序列分析图呢。”
“好,现在就去。”
叶蓁蓁匆忙扒完碗里的饭,催促着王亚楠去实验室,每次遇到这种奇怪的实验现象,叶蓁蓁和南之乔的反应一样,激动又兴奋。
王亚楠带着叶蓁蓁去了实验楼的计算机房,所有需要进行序列分析,建立进化树,基因测序的后续工作都在计算机房完成。
g省疾控计算机房规模颇大,六七十平米的房间里放着八台电脑,西面还放着一排文件柜,柜子前是一排办公桌,很空旷的感觉。
计算机房里已经有两个人坐在电脑前,王亚楠带着叶蓁蓁走进机房,众人点点头算是打过招呼。
王亚楠在一台电脑坐下,打开电脑,随手拖过来一张旋转椅让叶蓁蓁坐在旁边。
叶蓁蓁坐在一旁,看着王亚楠从电脑中调出昨天做出的炭疽杆菌序列图,看了两眼,叶蓁蓁就发现了问题,一个单独的序列突出在众序列之外,序列后面用英文标注着毒株名称,baizi anthracis ,叶蓁蓁指着电脑屏幕上单突出来的序列,问:“这就是从百子村死者身上分离出来的炭疽杆菌吧?”
“是的,下面这些是从国内各个炭疽流行区选出来的具有代表性的序列,对比分析后,从百子村新分离出来的这株炭疽杆菌因为与其他的同源性太低,所以系统软件将其单列出来一个分支。”周亚楠一边盯着电脑屏幕,一边用纳闷的口气说,“这就是这次炭疽疫情最奇怪的地方。”
叶蓁蓁心想,不会是新出现的变异株吧?每次细菌或病毒发生大的变异时,致病力都会发生相应的改变,这次百子村的祖孙四人发病急,症状严重,可能就是因为新出现的炭疽杆菌发生变异的缘故。
叶蓁蓁说出自己的想法,周亚楠点点头,解释说:“这个变异的可能,我之前也想过,所以打算今天对其中的几个毒力基因做一下分析。”
周亚楠开始调出各种炭疽杆菌的毒力基因,开始对比分析,边操作软件边说:“我们g省疾控用的这些序列分析软件还是南主任推荐的,分析方法也是之前去中国cdc统一培训过的,叶老师,这套分析软件和方法您也很熟悉吧?”
“嗯,这套分析软件是现在国际通用的,发表sci论文的时候也认可这种方法。”
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